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<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<meta charset="utf-8" />
<meta name="generator" content="pandoc" />
<meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=EDGE" />
<title>Herramientas Geostadisticas para Mapeo de enfermedades e Inferencia</title>
<script src="site_libs/header-attrs-2.6/header-attrs.js"></script>
<script src="site_libs/jquery-1.11.3/jquery.min.js"></script>
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1" />
<link href="site_libs/bootstrap-3.3.5/css/cosmo.min.css" rel="stylesheet" />
<script src="site_libs/bootstrap-3.3.5/js/bootstrap.min.js"></script>
<script src="site_libs/bootstrap-3.3.5/shim/html5shiv.min.js"></script>
<script src="site_libs/bootstrap-3.3.5/shim/respond.min.js"></script>
<script src="site_libs/navigation-1.1/tabsets.js"></script>
<link href="site_libs/highlightjs-9.12.0/default.css" rel="stylesheet" />
<script src="site_libs/highlightjs-9.12.0/highlight.js"></script>
<link href="site_libs/font-awesome-5.1.0/css/all.css" rel="stylesheet" />
<link href="site_libs/font-awesome-5.1.0/css/v4-shims.css" rel="stylesheet" />
<style type="text/css">
code{white-space: pre-wrap;}
span.smallcaps{font-variant: small-caps;}
span.underline{text-decoration: underline;}
div.column{display: inline-block; vertical-align: top; width: 50%;}
div.hanging-indent{margin-left: 1.5em; text-indent: -1.5em;}
ul.task-list{list-style: none;}
</style>
<style type="text/css">code{white-space: pre;}</style>
<style type="text/css">
pre:not([class]) {
background-color: white;
}
</style>
<script type="text/javascript">
if (window.hljs) {
hljs.configure({languages: []});
hljs.initHighlightingOnLoad();
if (document.readyState && document.readyState === "complete") {
window.setTimeout(function() { hljs.initHighlighting(); }, 0);
}
}
</script>
<style type="text/css">
h1 {
font-size: 34px;
}
h1.title {
font-size: 38px;
}
h2 {
font-size: 30px;
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font-size: 24px;
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font-size: 18px;
}
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font-size: 16px;
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h6 {
font-size: 12px;
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.table th:not([align]) {
text-align: left;
}
</style>
<style type = "text/css">
.main-container {
max-width: 940px;
margin-left: auto;
margin-right: auto;
}
code {
color: inherit;
background-color: rgba(0, 0, 0, 0.04);
}
img {
max-width:100%;
}
.tabbed-pane {
padding-top: 12px;
}
.html-widget {
margin-bottom: 20px;
}
button.code-folding-btn:focus {
outline: none;
}
summary {
display: list-item;
}
</style>
<style type="text/css">
/* padding for bootstrap navbar */
body {
padding-top: 51px;
padding-bottom: 40px;
}
/* offset scroll position for anchor links (for fixed navbar) */
.section h1 {
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.section h2 {
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padding-top: 56px;
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.section h5 {
padding-top: 56px;
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}
.section h6 {
padding-top: 56px;
margin-top: -56px;
}
.dropdown-submenu {
position: relative;
}
.dropdown-submenu>.dropdown-menu {
top: 0;
left: 100%;
margin-top: -6px;
margin-left: -1px;
border-radius: 0 6px 6px 6px;
}
.dropdown-submenu:hover>.dropdown-menu {
display: block;
}
.dropdown-submenu>a:after {
display: block;
content: " ";
float: right;
width: 0;
height: 0;
border-color: transparent;
border-style: solid;
border-width: 5px 0 5px 5px;
border-left-color: #cccccc;
margin-top: 5px;
margin-right: -10px;
}
.dropdown-submenu:hover>a:after {
border-left-color: #ffffff;
}
.dropdown-submenu.pull-left {
float: none;
}
.dropdown-submenu.pull-left>.dropdown-menu {
left: -100%;
margin-left: 10px;
border-radius: 6px 0 6px 6px;
}
</style>
<script>
// manage active state of menu based on current page
$(document).ready(function () {
// active menu anchor
href = window.location.pathname
href = href.substr(href.lastIndexOf('/') + 1)
if (href === "")
href = "index.html";
var menuAnchor = $('a[href="' + href + '"]');
// mark it active
menuAnchor.parent().addClass('active');
// if it's got a parent navbar menu mark it active as well
menuAnchor.closest('li.dropdown').addClass('active');
});
</script>
<!-- tabsets -->
<style type="text/css">
.tabset-dropdown > .nav-tabs {
display: inline-table;
max-height: 500px;
min-height: 44px;
overflow-y: auto;
background: white;
border: 1px solid #ddd;
border-radius: 4px;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li.active:before {
content: "";
font-family: 'Glyphicons Halflings';
display: inline-block;
padding: 10px;
border-right: 1px solid #ddd;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs.nav-tabs-open > li.active:before {
content: "";
border: none;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs.nav-tabs-open:before {
content: "";
font-family: 'Glyphicons Halflings';
display: inline-block;
padding: 10px;
border-right: 1px solid #ddd;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li.active {
display: block;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li > a,
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li > a:focus,
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li > a:hover {
border: none;
display: inline-block;
border-radius: 4px;
background-color: transparent;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs.nav-tabs-open > li {
display: block;
float: none;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li {
display: none;
}
</style>
<!-- code folding -->
</head>
<body>
<div class="container-fluid main-container">
<div class="navbar navbar-default navbar-fixed-top" role="navigation">
<div class="container">
<div class="navbar-header">
<button type="button" class="navbar-toggle collapsed" data-toggle="collapse" data-target="#navbar">
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<li>
<a href="index.html">Home</a>
</li>
<li>
<a href="Research.html">About Me</a>
</li>
<li>
<a href="CV.html">CV</a>
</li>
<li>
<a href="Training.html">Training</a>
</li>
<li class="dropdown">
<a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-expanded="false">
Contact
<span class="caret"></span>
</a>
<ul class="dropdown-menu" role="menu">
<li>
<a href="https://github.com/jpablo91">
<span class="fas fa-github-alt"></span>
Github
</a>
</li>
<li>
<a href="https://www.linkedin.com/in/pablo-gomez-v-b19553129/">
<span class="fas fa-linkedin"></span>
LinkedIn
</a>
</li>
<li>
<a href="mailto:[email protected]">
<span class="fas fa-optin-monster"></span>
email me
</a>
</li>
<li>
<a href="https://synthesaurio.github.io">
<span class="fas fa-user-secret"></span>
Synthesaurio
</a>
</li>
</ul>
</li>
</ul>
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</div><!--/.container -->
</div><!--/.navbar -->
<div class="fluid-row" id="header">
<h1 class="title toc-ignore">Herramientas Geostadisticas para Mapeo de enfermedades e Inferencia</h1>
</div>
<p><strong>Objetivo:</strong> Proveer una vision general sobre las herramientas disponibles que podemos usar en geoestadistica para el mapeo de enfermedades e inferencia.</p>
<div id="introduccion" class="section level1">
<h1>Introduccion:</h1>
<p>De acurdo a la primera ley de geografia de Tobler, <em>“todo esta relacionado entre si, pero eventos que suceden cerca tienen mayor relacion comparados con eventos que suceden a mayor distancia”</em>. Este no siempre consideramos cuando realizamos inferencia estadistica, y para la mayoria de los metodos estadisticos (por ejemplo regression), asumimos que las observaciones fueron muestreadas de manera independiente.<br />
En este Workshop introduciremos, desde lo mas basico, a metodos para manipular y analizar datos espaciales. Con las tecnologías actuales, la cantidad de informacion disponeible puede ser un poco abrumadora cuando intentamos encontrar asociaciones entre dos o mas eventos. Existen muchos recursos que pueden ayudarnos a informar de mejor manera nuestros modelos estadisticos y obtener mas informacion de nuestros datos. Herramientas de libre acceso, tales como QGIS y <code>R</code>, ofrecen un medio muy flexible para manipular y analizar este tipo de datos.<br />
Para este workshop usaremos ejemplos en epidemiologia, el workshop esta orientado a entender conceptos en epidemiologia tales como asociacion, causalidad y confusion. Estos conceptos pueden ser aplicados a cualquier area en la que busquemos la asociacion entre dos o mas eventos.</p>
<hr />
</div>
<div id="instructor" class="section level1">
<h1>Instructor</h1>
<p><strong>Jose Pablo Gomez-Vazquez</strong> (PhDc, MPVM, DVM), Universidad de California Davis. Pablo es un candidato de doctorado realizando su trabajo en el Center for Animal Disease Modeling and Surveillance de UC Davis. Sus intereses incluyen la aplicacion de teoria de redes y geoestadistica para informar politicas publicas y toma de decisiones en epidemiologia. Pablo ha trabajado con instituciones gubernamentales en Peru, Ecuador y California, proporcionando herramientas que pueden ser usadas en toma de decisiones.</p>
<hr />
</div>
<div id="resultados-de-aprendizaje" class="section level1">
<h1>Resultados de aprendizaje</h1>
<ul>
<li>Entender la estructura de datos espaciales (Vectores y Rasters)</li>
<li>Extraer y procesar datos espaciales</li>
<li>Inferencia estadistica para datos no espaciales</li>
<li>Correlacion e inferencia estadistica para datos espaciales</li>
<li>Visualizacion y presentacion de los resultados</li>
</ul>
<hr />
</div>
<div id="estructura-del-curso" class="section level1">
<h1>Estructura del curso:</h1>
<div id="modulo-basico" class="section level2">
<h2>Modulo basico</h2>
<ul>
<li>Fundamentos de SIGs (QGIS)
<ul>
<li>Estructura de datos espaciales.<br />
</li>
<li>Sistemas de coordenadas geograficas.</li>
</ul></li>
<li>Manipulacion de bases de datos en R:
<ul>
<li>Operaciones con vectores.<br />
</li>
<li>Operaciones con rasters.</li>
<li>Proyeccion y transformacion de los datos.<br />
</li>
<li>Geocodificacion de datos.<br />
</li>
<li>Limpieza y procesamiento de datos.</li>
</ul></li>
<li>Herramientas para visualizacion de datos
<ul>
<li>Visualizacion estatica y generacion de reportes.<br />
</li>
<li>Visualizacion dinamica mediante videos, gifs y applicaciones web.</li>
</ul></li>
<li>Analisis de datos espaciales
<ul>
<li>Operaciones basadas en distancia<br />
</li>
<li>Adjacencia.<br />
</li>
<li>Autocorrelacion espacial.<br />
</li>
<li>Clustering: Estadisticas globales y locales.</li>
</ul></li>
</ul>
</div>
</div>
<div id="horario" class="section level1">
<h1>Horario</h1>
<p>Este workshop puede ser ofrecido en diferentes formatos, anteriormente fue ofrecido como un workshop de 3 dias en los que se cubrieron temas desde lo mas basico de como usar <code>R</code> hasta inferencia geoestadistica con modelos de regression.<br />
El horario varia dependiendo del tiempo disponible y los conocimientos deseados de los participantes.</p>
<hr />
</div>
<div id="antecedesntes-y-habilidades-de-los-participantes" class="section level1">
<h1>Antecedesntes y habilidades de los participantes</h1>
<p>Este workshop esta diseñado para estudiantes y profesionistas interesados en estadistica y sistemas de informacion geograficos. Experiencia basica en estadistica y R son deseados, pero no necesarios. En el pasado, este workshop fue ofrecido para gente de la academia e instituciones gubernamentales.<br />
Para este workshop usaremos principalmente <code>R</code> y Rstudio, pero otras herramientas como QGIS y Google Earth tambien seran usadas con propositos de demostrar aplicaciones de los resultados.</p>
</div>
</div>
<script>
// add bootstrap table styles to pandoc tables
function bootstrapStylePandocTables() {
$('tr.odd').parent('tbody').parent('table').addClass('table table-condensed');
}
$(document).ready(function () {
bootstrapStylePandocTables();
});
</script>
<!-- tabsets -->
<script>
$(document).ready(function () {
window.buildTabsets("TOC");
});
$(document).ready(function () {
$('.tabset-dropdown > .nav-tabs > li').click(function () {
$(this).parent().toggleClass('nav-tabs-open')
});
});
</script>
<!-- code folding -->
<!-- dynamically load mathjax for compatibility with self-contained -->
<script>
(function () {
var script = document.createElement("script");
script.type = "text/javascript";
script.src = "https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML";
document.getElementsByTagName("head")[0].appendChild(script);
})();
</script>
</body>
</html>