ベイズ統計モデリングとMCMC

農研機構短期集合研修（数理統計）「ベイズ統計モデリングとMCMC」で使用するファイルです。

テキストと投影資料

テキスト(PDF)(CC-BY 4.0)
投影資料(PDF)

例題1: ポアソン回帰

example1.R: Rスクリプト
example1_model.txt: BUGSモデル

例題2: ロジスティック回帰

example2.R: Rスクリプト（JAGS用）
example2_model.txt: BUGSモデル
example2_Stan.R: Rスクリプト（Stan用）
example2.stan: Stanモデル
example2_nimble.R: Rスクリプト（NIMBLE用）

例題3: 線形混合モデル

example3.csv: データ
example3.R: Rスクリプト（JAGS用）
example3_model.txt: BUGSモデル
example3-1_model.txt: BUGSモデル (nested indexing)
example3_Stan.R: Rスクリプト（Stan用）
example3.stan: Stanモデル

例題4: ゼロ過剰ポアソンモデル

example4.csv: データ
example4.R: Rスクリプト（JAGS用）
example4_model.txt: BUGSモデル
example4_Stan.R: Rスクリプト（Stan用）
example4.stan: Stanモデル

テキスト

mcmc_text/*: テキストのTeXソースファイルおよび画像データ