-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathindex.qmd
963 lines (811 loc) · 64.5 KB
/
index.qmd
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
---
title: "Using {openmeteo} package with Quarto dashboard"
author:
name: Alexander Rodionov
email: [email protected]
roles: "Ph.D., Data Scientist"
date_start: "7 November 2024"
# orientation: columns
params:
# loc_name: 'Sossusvlei' # The driest place on Earth
# loc_code: 'SOS'
# loc_coordinats: !expr "c('latitude' = -24.7373, 'longitude' = 15.287)"
# loc_name: 'Almaty City' # Place of birth
# loc_code: 'ALA' # 'PQC'
# loc_coordinats: !expr "c('latitude' = 43.25, 'longitude' = 76.93)" # "c('latitude' = 10.2872, 'longitude' = 104.0105)"
# loc_name: 'Lloro' # The rainiest place on Earth
# loc_code: 'LLR'
# loc_coordinats: !expr "c('latitude' = 5.4961, 'longitude' = -76.5494)"
# loc_name: 'Phuquoc Island' # The largest island in Vietnam
# loc_code: 'PQC'# 'ALA'
# loc_coordinats: !expr "c('latitude' = 10.2872, 'longitude' = 104.0105)" # "c('latitude' = 43.25, 'longitude' = 76.93)"
loc_name: 'Oymyakon Vilage' # The coldest inhabited place on Earth
loc_code: 'OYM'
loc_coordinats: !expr "c('latitude' = 63.4622, 'longitude' = 142.7949)"
Start_Date: 1994-11-01
Finish_Date: 2024-11-01
---
```{r}
#| label: setup
#| include: false
# Global options
# https://www.meteoblue.com/ru/%D0%BF%D0%BE%D0%B3%D0%BE%D0%B4%D0%B0/historyclimate/climatemodelled/%d0%90%d0%bb%d0%bc%d0%b0%d1%82%d1%8b_%d0%9a%d0%b0%d0%b7%d0%b0%d1%85%d1%81%d1%82%d0%b0%d0%bd_1526384
# https://open-meteo.com/en/docs/historical-weather-api#latitude=63.4622&longitude=142.7949&start_date=2020-01-01&end_date=2024-09-15&hourly=&daily=weather_code,temperature_2m_max,temperature_2m_min,temperature_2m_mean,apparent_temperature_max,apparent_temperature_min,apparent_temperature_mean,sunrise,sunset,daylight_duration,sunshine_duration,precipitation_sum,rain_sum,snowfall_sum,precipitation_hours,wind_speed_10m_max,wind_gusts_10m_max,wind_direction_10m_dominant,shortwave_radiation_sum,et0_fao_evapotranspiration&timezone=auto
```
# Overview
```{r}
#| label: Libraries
library('ggplot2') # Create Elegant Data Visualisations Using the Grammar of Graphics
library('dplyr') # A Grammar of Data Manipulation
library('purrr') # Functional Programming Tools
library('tibble') # Simple Data Frames
library('lubridate') # Dates and times made easy with lubridate
library('tidyr') # Tidy Messy Data
library('arrow') # Integration to 'Apache' 'Arrow'
library('rlang') # Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features
library('forcats') # Tools for Working with Categorical Variables (Factors)
library('janitor') # Simple Tools for Examining and Cleaning Dirty Data
library('DT') # A Wrapper of the JavaScript Library 'DataTables'
library('leaflet') # Create Interactive Web Maps with the JavaScript 'Leaflet' Library
# devtools::install_github('tpisel/openmeteo')
library('openmeteo') # Retrieve Weather Data from the Open-Meteo API
Subtitle <-
paste0(params$loc_name, " (", round(params$loc_coordinats['latitude'], digi = 2), ifelse(params$loc_coordinats['latitude'] > 0, "°N Lat, ", "°S Lat, "), round(params$loc_coordinats['longitude'], digi = 2), ifelse(params$loc_coordinats['longitude'] > 0, "°E Lng)", "°W Lng)"))
```
---
subtitle: "for **`r Subtitle`** by"
---
```{r}
#| label: Meteo Dictionaries
# WMO CODE TABLE 4677 - https://www.nodc.noaa.gov/archive/arc0021/0002199/1.1/data/0-data/HTML/WMO-CODE/WMO4677.HTM
WCO_Codes_tbl <-
tibble::tribble( ~`weather_code`, ~Weather,
# Текущая погода
0, 'Развитие облаков не наблюдается или не наблюдается (Характерное изменение состояния неба за последний час)',
1, 'Облака в целом рассеиваются или становятся менее развитыми (Характерное изменение состояния неба за последний час)',
2, 'Состояние неба в целом не изменилось. (Характерное изменение состояния неба за последний час)',
3, 'Облака, как правило, формируются или развиваются (Характерное изменение состояния неба за последний час)',
4, 'Видимость снижена из-за дыма, например, от лесных пожаров, промышленного дыма или вулканического пепла.',
5, 'Туман',
6, 'Широко распространенная пыль, взвешенная в воздухе, не поднятая ветром на станции или вблизи нее во время наблюдения.',
7, 'Пыль или песок, поднятые ветром на станции или около нее во время наблюдения, но не было хорошо развитых пылевых или песчаных вихрей, а также не наблюдалось пыльной или песчаной бури.',
8, 'Хорошо развитые пылевые вихри или песчаные вихри, наблюдавшиеся на станции или вблизи нее в течение предыдущего часа или во время наблюдения, но без пыльной или песчаной бури',
9, 'Пыльная или песчаная буря в пределах видимости во время наблюдения или на станции в течение предыдущего часа',
10, 'Туман',
11, 'Патчи (мелкий туман или ледяной туман на станции, будь то на суше или на море, не глубже примерно 2 метров на суше или 10 метров на море)',
12, 'Более или менее непрерывный (мелкий туман или ледяной туман на станции, будь то на суше или на море, не глубже примерно 2 метров на суше или 10 метров на море)',
13, 'Молния видна, грома не слышно',
14, 'Осадки в пределах видимости, не достигающие земли или поверхности моря',
15, 'Осадки в пределах видимости, достигающие земли или поверхности моря, но удаленные, т.е. по оценкам, находящиеся на расстоянии более 5 км от станции',
16, 'Осадки в пределах видимости, достигающие земли или поверхности моря, вблизи станции, но не на ней',
17, 'Гроза, но на момент наблюдения осадков не было',
18, 'Шквалы (на станции или в пределах ее видимости в течение предыдущего часа или во время наблюдения)',
19, 'Воронкообразное облако(а) ** (на станции или в пределах ее видимости в течение предыдущего часа или во время наблюдения)',
# Осадки, туман, ледяной туман или гроза на станции в течение предыдущего часа, но не в момент наблюдения
20, 'Морось (не замерзающая) или снежные зерна (не падает как ливень(и))',
21, 'Дождь (не замерзающий) (не падает как ливень(и))',
22, 'Снег (не падает как ливень(и))',
23, 'Дождь и снег или ледяная крупа (не падает как ливень(и))',
24, 'Замерзающая морось или ледяной дождь (не падает как ливень(и))',
25, 'Ливень(и) дождя',
26, 'Снегопад или дождь со снегом',
27, 'Ливень(и) града * или дождя с градом *',
28, 'Туман или ледяной туман',
29, 'Гроза (с осадками или без них)',
# Пыльная буря, песчаная буря, метель или снежная метель
30, 'Небольшая или умеренная пыльная или песчаная буря (- уменьшилось в течение предыдущего часа)',
31, 'Небольшая или умеренная пыльная или песчаная буря (- никаких существенных изменений в течение предыдущего часа)',
32, 'Небольшая или умеренная пыльная или песчаная буря (- началось или усилилось в течение предыдущего часа)',
33, 'Сильная пыльная или песчаная буря (- уменьшилось в течение предыдущего часа)',
34, 'Сильная пыльная или песчаная буря (- никаких существенных изменений в течение предыдущего часа)',
35, 'Сильная пыльная или песчаная буря (- началось или усилилось в течение предыдущего часа)',
36, 'Слабая или умеренная метель (обычно низкий (ниже уровня глаз))',
37, 'Сильный снежный поземок (обычно низкий (ниже уровня глаз))',
38, 'Слабая или умеренная метель (обычно высокий (выше уровня глаз))',
39, 'Сильный снежный поземок (обычно высокий (выше уровня глаз))',
# Туман или ледяной туман во время наблюдения
40, 'Туман или ледяной туман на расстоянии во время наблюдения, но не на станции в течение предыдущего часа, причем туман или ледяной туман распространяется на уровень выше уровня наблюдателя',
41, 'Туман или ледяной туман местами',
42, 'Туман или ледяной туман, небо видно (стал тоньше в течение предыдущего часа)',
43, 'Туман или ледяной туман, небо не видно (стал тоньше в течение предыдущего часа)',
44, 'Туман или ледяной туман, небо видно (никаких существенных изменений в течение предыдущего часа)',
45, 'Туман или ледяной туман, небо не видно (никаких существенных изменений в течение предыдущего часа)',
46, 'Туман или ледяной туман, небо видно (начался или стал гуще в течение предыдущего часа)',
47, 'Туман или ледяной туман, небо не видно (начался или стал гуще в течение предыдущего часа)',
48, 'Туман, налипает изморозь, небо видно',
49, 'Туман, налипающий иней, небо невидимо',
# Морось
50, 'Морось, не замерзающая, кратковременная (незначительный во время наблюдения)',
51, 'Морось, не замерзающая, непрерывная (незначительный во время наблюдения)',
52, 'Морось, не замерзающая, кратковременная (умеренный на момент наблюдения)',
53, 'Морось, не замерзающая, непрерывная (умеренный на момент наблюдения)',
54, 'Морось, не замерзающая, кратковременная (сильный на момент наблюдения)',
55, 'Морось, не замерзающая, непрерывная (сильный на момент наблюдения)',
56, 'Морось, замерзающая, слабая',
57, 'Морось, замерзающая, умеренная или сильная (густая)',
58, 'Морось и дождь, слабый',
59, 'Морось и дождь, умеренный или сильный',
# Дождь
60, 'Дождь, не замерзающий, кратковременный (незначительный во время наблюдения)',
61, 'Дождь, не замерзающий, непрерывный (незначительный во время наблюдения)',
62, 'Дождь, не замерзающий, кратковременный (умеренный на момент наблюдения)',
63, 'Дождь, не замерзающий, непрерывный (умеренный на момент наблюдения)',
64, 'Дождь, не замерзающий, кратковременный (тяжелый во время наблюдения)',
65, 'Дождь, не замерзающий, непрерывный (тяжелый во время наблюдения)',
66, 'Дождь, морозный, слабый',
67, 'Дождь, замерзающий, умеренный или сильный (плотный)',
68, 'Дождь или морось со снегом, слабый',
69, 'Дождь или морось со снегом, умеренный или сильный',
# Твердые осадки без ливней
70, 'Прерывистое падение снежинок (незначительный во время наблюдения)',
71, 'Непрерывное падение снежинок (незначительный во время наблюдения)',
72, 'Прерывистое падение снежинок (умеренный на момент наблюдения)',
73, 'Непрерывное падение снежинок (умеренный на момент наблюдения)',
74, 'Прерывистое падение снежинок (тяжелый во время наблюдения)',
75, 'Непрерывное падение снежинок (тяжелый во время наблюдения)',
76, 'Алмазная пыль (с туманом или без него)',
77, 'Снежные зерна (с туманом или без него)',
78, 'Изолированные снежные кристаллы в форме звезд (с туманом или без него)',
79, 'Ледяные гранулы',
# Ливневые осадки или осадки с текущей или недавней грозой
80, 'Ливневый дождь(ы), слабый',
81, 'Ливневый(ые) дождь(и), умеренный или сильный',
82, 'Ливень(и), сильный',
83, 'Ливень(и) со снегом, слабый',
84, 'Ливень(и) со снегом, смешанный, умеренный или сильный',
85, 'Снежный ливень(и), небольшой',
86, 'Снегопад(ы), умеренный или сильный',
87, 'Ливень(и) в виде снежной крупы или мелкого града, с дождем или без него, или смешанный с дождем и снегом (- небольшой)',
88, 'Ливень(и) в виде снежной крупы или мелкого града, с дождем или без него, или смешанный с дождем и снегом (- умеренный или тяжелый)',
89, 'Ливень(и) града * , с дождем или без него или смешанный с дождем и снегом, не связанный с грозой (- небольшой)',
90, 'Ливень(и) града * , с дождем или без него или смешанный с дождем и снегом, не связанный с грозой (- умеренный или тяжелый)',
91, 'Небольшой дождь во время наблюдения (Гроза в течение предыдущего часа, но не в момент наблюдения)',
92, 'Умеренный или сильный дождь во время наблюдения (Гроза в течение предыдущего часа, но не в момент наблюдения)',
93, 'Небольшой снег или дождь со снегом или град ** во время наблюдения (Гроза в течение предыдущего часа, но не в момент наблюдения)',
94, 'Умеренный или сильный снег, или дождь со снегом или град ** во время наблюдения (Гроза в течение предыдущего часа, но не в момент наблюдения)',
95, 'Гроза слабая или умеренная, без града **, но с дождем и/или снегом в момент наблюдения (Гроза во время наблюдения)',
96, 'Гроза слабая или умеренная с градом ** в момент наблюдения (Гроза во время наблюдения)',
97, 'Гроза сильная, без града **, но с дождем и/или снегом в момент наблюдения (Гроза во время наблюдения)',
98, 'Гроза в сочетании с пыльной или песчаной бурей во время наблюдения (Гроза во время наблюдения)',
99, 'Гроза сильная с градом ** в момент наблюдения (Гроза во время наблюдения)',
)
# Oceanic Niño Index - https://origin.cpc.ncep.noaa.gov/products/analysis_monitoring/ensostuff/ONI_v5.php
ONI_tbl <- tibble::tribble(
~`Start Month`, ~`Finish Month`, ~Conditions,
"2000-01-01", "2001-02-28", "La Niña",
"2001-03-01", "2002-05-31", "Neutral",
"2002-06-01", "2003-02-28", "El Niño",
"2003-03-01", "2004-06-30", "Neutral",
"2004-07-01", "2005-02-28", "El Niño",
"2005-03-01", "2005-10-31", "Neutral",
"2005-11-01", "2006-03-31", "La Niña",
"2006-04-01", "2006-08-31", "Neutral",
"2006-09-01", "2007-01-31", "El Niño",
"2007-02-01", "2007-05-31", "Neutral",
"2007-06-01", "2008-06-30", "La Niña",
"2008-07-01", "2008-10-31", "Neutral",
"2008-11-01", "2009-03-31", "La Niña",
"2009-04-01", "2009-06-30", "Neutral",
"2009-07-01", "2010-03-31", "El Niño",
"2010-04-01", "2010-05-31", "Neutral",
"2010-06-01", "2011-05-31", "La Niña",
"2011-06-01", "2011-06-30", "Neutral",
"2011-07-01", "2012-04-30", "La Niña",
"2012-05-01", "2014-09-30", "Neutral",
"2014-10-01", "2016-04-30", "El Niño",
"2016-05-01", "2016-06-30", "Neutral",
"2016-07-01", "2016-12-31", "La Niña",
"2017-01-01", "2017-07-31", "Neutral",
"2017-08-01", "2018-03-31", "La Niña",
"2018-04-01", "2018-08-31", "Neutral",
"2018-09-01", "2019-06-30", "El Niño",
"2019-07-01", "2020-07-31", "Neutral",
"2020-08-01", "2021-05-31", "La Niña",
"2021-06-01", "2021-07-31", "Neutral",
"2021-08-01", "2023-01-31", "La Niña",
"2023-02-01", "2023-04-30", "Neutral",
"2023-05-01", "2024-04-30", "El Niño",
"2024-05-01", "2024-12-31", "Neutral"
) |>
dplyr::mutate(`Start Month` = as.Date(`Start Month`, tz = 'Asia/Ho_Chi_Minh'),
`Finish Month` = as.Date(`Finish Month`, tz = 'Asia/Ho_Chi_Minh'))
MonthDays_tbl <-
tibble::tibble(Month = month.abb, Days = c(31, 28.24, 31, 30, 31, 30, 31, 31, 30, 31, 30, 31))
# Function to scale secondary axis
scale_function <- function(x, scale, shift){
return ((x)*scale - shift)
}
# Function to scale secondary variable values
inv_scale_function <- function(x, scale, shift){
return ((x + shift)/scale)
}
# Function to find the closest multiple of 5 that is not greater than x
nearest_multiple_of_5_down_function <- function(x) {
return(floor(x / 5) * 5)
}
```
```{r}
#| label: Loading dataset
#| title: Retrieve historical weather data from the Open-Meteo API
prq_daily_filename <- paste0('data/meteo_daily_', params$loc_code, '.zst.parquet')
prq_hourly_filename <- paste0('data/meteo_hourly_', params$loc_code, '.zst.parquet')
# meteo_daily_df <- # obtain Weather history for Location over 1950
# openmeteo::weather_history( # location = c('latitude' = 43.25, 'longitude' = 76.93), # Almaty city
# location = params$loc_coordinats,
# start = params$Start_Dat,
# end = params$Finish_Date,
# daily = c("weather_code", "temperature_2m_max", "temperature_2m_min", "temperature_2m_mean", "apparent_temperature_max", "apparent_temperature_min", "apparent_temperature_mean", "sunrise", "sunset", "daylight_duration", "sunshine_duration", "precipitation_sum", "rain_sum", "snowfall_sum", "precipitation_hours", "wind_speed_10m_max", "wind_gusts_10m_max", "wind_direction_10m_dominant", "shortwave_radiation_sum", "et0_fao_evapotranspiration") ) # openmeteo::weather_variables()[['daily_history_vars']] )
#
# Sys.sleep(61) # Delay 61 seconds
#
# meteo_hourly_df <- # obtain Weather history for Location over 1950
# openmeteo::weather_history( # location = c('latitude' = 43.25, 'longitude' = 76.93), # Almaty city
# location = params$loc_coordinats,
# start = params$Start_Dat,
# end = params$Finish_Date,
# hourly = c("temperature_2m", "relative_humidity_2m", "dew_point_2m", "apparent_temperature", "precipitation", "rain", "snowfall", "snow_depth", "weather_code", "pressure_msl", "cloud_cover", "et0_fao_evapotranspiration", "vapour_pressure_deficit", "wind_speed_10m", "wind_direction_10m", "wind_gusts_10m", "is_day", "sunshine_duration", "shortwave_radiation") )
if (exists('meteo_daily_df') == TRUE) {
arrow::write_parquet( meteo_daily_df, prq_daily_filename, compression = 'zstd', compression_level = 6)
} else {
meteo_daily_df = arrow::read_parquet(file = prq_daily_filename)
} # The End of if (exists('meteo_daily_df') == TRUE)
if (exists('meteo_hourly_df') == TRUE) {
arrow::write_parquet( meteo_hourly_df, prq_hourly_filename, compression = 'zstd', compression_level = 6)
} else {
meteo_hourly_df = arrow::read_parquet(file = prq_hourly_filename)
} # The End of if (exists('meteo_hourly_df') == TRUE)
dur <- paste0( format(as.Date(params$Start_Date), '%b %Y'), ' - ', format(as.Date(params$Finish_Date), '%b %Y') )
remove(prq_daily_filename, prq_hourly_filename)
```
```{r}
#| label: Merge dataset
#| expandable: false
#### I. Merge Weather Dataset with WCO Codes Dictionary
meteo_tbl <-
dplyr::inner_join(
x = meteo_daily_df,
y = dplyr::mutate( meteo_hourly_df # Month = factor(lubridate::month(datetime), labels = month.abb)
, date = lubridate::as_date(datetime)
, cloud_cover = dplyr::if_else(hourly_cloud_cover >= 80, 3,
dplyr::if_else(hourly_cloud_cover < 20, 1, 2)) ) |>
dplyr::group_by(date) |> # Month,
# dplyr::summarise(dplyr::across(dplyr::one_of('hourly_temperature_2m', 'hourly_apparent_temperature'),
# list(max = max, min = min, mean = mean), .names = "{.col}_{.fn}"), .groups = 'drop') |>
# dplyr::rename_with(~ gsub('^hourly_', 'daily_', .), dplyr::starts_with('hourly_'))
dplyr::summarise( cloud_cover = dplyr::if_else( mean(cloud_cover) <= 1.3, 'Sunny',
dplyr::if_else( mean(cloud_cover) == 3, 'Overcast', 'Partly Cloudy'))
, daily_relative_humidity_2m_max = max(hourly_relative_humidity_2m, na.rm = TRUE)
, daily_relative_humidity_2m_min = min(hourly_relative_humidity_2m, na.rm = TRUE)
, daily_snow_depth_max = max(hourly_snow_depth, na.rm = TRUE) ),
by = dplyr::join_by( date == date )
) |>
dplyr::left_join( y = WCO_Codes_tbl
, by = c('daily_weather_code' = 'weather_code'), relationship = 'many-to-one' ) |>
dplyr::left_join( y = ONI_tbl,
by = dplyr::join_by( dplyr::between(date, `Start Month`, `Finish Month`)),
relationship = 'many-to-many') |>
dplyr::select( -tidyselect::ends_with(' Month') ) |>
dplyr::mutate(Month = factor(lubridate::month(date), labels = month.abb))
# remove(meteo_hourly_df, meteo_daily_df, WCO_Codes_tbl, ONI_tbl)
```
## Row - <i class="bi bi-calendar-range"></i> Value boxes {height="20%"}
```{r}
#| content: valuebox
#| label: Years
#| title: !expr "dur"
#| subtitle: !expr "paste('Duration of observation:', format(as.Date(params$Start_Date), '%b %Y'), '---', format(as.Date(params$Finish_Date), '%b %Y'))"
# Value Boxes with Icons - https://icons.getbootstrap.com/
list(
icon = 'calendar-range',
color = '#eed5b7',
value = lubridate::interval(lubridate::ymd(params$Start_Date), lubridate::ymd(params$Finish_Date)) |>
lubridate::as.duration() |> as.integer('year') |> paste('Years')
)
```
```{r}
#| content: valuebox
#| label: Mean Annual Temperature
#| title: Mean Annual Temperature
list(
icon = 'thermometer-sun',
color = 'success',
value = round( mean(meteo_tbl$daily_temperature_2m_mean, na.rm = TRUE), digi = 1 ) |> paste0('°C')
)
```
```{r}
#| content: valuebox
#| label: Average Annual Precipitation
#| title: Average Annual Precipitation
list(
icon = 'cloud-rain',
color = 'blue',
value = format( round(mean(meteo_tbl$daily_precipitation_sum, na.rm = TRUE) * 365.24, digi = 0), big.mark = ' ') |> paste('mm')
)
```
```{r}
#| content: valuebox
#| label: Mean Number of Days per Year without Precipitation
#| title: Mean Days w/o Precipitation in Year
#| fill: false
list(
icon = 'sun',
color = '#fffacd',
value = round(meteo_tbl |> dplyr::filter(daily_precipitation_sum == 0) |> nrow() / nrow(meteo_tbl) * 365.24) |> paste('Days')
)
```
## Row - Charts {height="80%"}
### Sidebar - Load Dataset from OpenMeteo (Daily Weather Variables) {.card-sidebar width="16%"}
#### Daily Parameter Definition
<small>
Historical data can be downloaded directly using the package [{openmeteo}](https://tpisel.r-universe.dev/openmeteo) from [**Open-Meteo API**](https://open-meteo.com/en/docs), since it has the ability to take the following **daily** variables.
| Variable | Unit | Description |
|:--------:|:----:|:------------|
| **weather_code** | WMO code | The most severe weather condition on a given day |
| **temperature_2m_max temperature_2m_min** | °C (°F) | Maximum and minimum daily air temperature at 2 meters above ground |
| **apparent_temperature_max apparent_temperature_min** | °C (°F) | Maximum and minimum daily apparent temperature |
| **precipitation_sum** | mm | Sum of daily precipitation (including rain, showers and snowfall) |
| **rain_sum** | mm | Sum of daily rain |
| **snowfall_sum** | cm | Sum of daily snowfall |
| **precipitation_hours** | hours | The number of hours with rain |
| **sunrise sunset** | iso8601 | Sun rise and set times |
| **sunshine_duration** | seconds | The number of seconds of sunshine per day is determined by calculating direct normalized irradiance exceeding 120 W/m², following the WMO definition. Sunshine duration will consistently be less than daylight duration due to dawn and dusk. |
| **daylight_duration** | seconds | Number of seconds of daylight per day |
| **wind_speed_10m_max wind_gusts_10m_max** | km/h (mph, m/s, knots) | Maximum wind speed and gusts on a day |
| **wind_direction_10m_dominant** | ° | Dominant wind direction |
| **shortwave_radiation_sum** | MJ/m² | The sum of solar radiaion on a given day in Megajoules |
| **et0_fao_evapotranspiration** | mm | Daily sum of ET₀ Reference Evapotranspiration of a well watered grass field |
</small>
### Column - Overview Conditions {width="42%"}
```{r}
#| label: Overview Air Temperature & Precipitation Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Функция для создания графика по среднемесячным температурам воздуха и выпадению осадкам
Union_plot <- function(data, from = min(data$date, na.rm = TRUE), to = max(data$date, na.rm = TRUE)) {
data <-
data |>
dplyr::filter(date >= from & date <= to) |>
# Среднемесячная максимальная, средняя и минимальная температура воздуха
dplyr::group_by(Month) |>
dplyr::summarise( high_month = base::max(daily_temperature_2m_max, na.rm = TRUE),
max_day = base::max(daily_temperature_2m_mean, na.rm = TRUE),
avg_max_day = base::mean(daily_temperature_2m_max, na.rm = TRUE),
median = stats::median(daily_temperature_2m_mean, na.rm = TRUE),
avg_min_day = base::mean(daily_temperature_2m_min, na.rm = TRUE),
min_day = base::min(daily_temperature_2m_mean, na.rm = TRUE),
low_month = base::min(daily_temperature_2m_min, na.rm = TRUE), .groups = 'drop' ) |>
# Среднемесячное количество атмосферных осадков
dplyr::full_join( y = data |>
dplyr::mutate( period = sprintf("%2.0f-%02.0f", lubridate::year(date) - 2000, lubridate::month(date)) ) |>
dplyr::group_by(period) |>
dplyr::summarise( Month = dplyr::first(Month),
precipitation_sum = sum(daily_precipitation_sum, na.rm = TRUE), .groups = 'drop' ) |>
dplyr::group_by(Month) |>
dplyr::summarise( Precipitation = mean(precipitation_sum, na.rm = TRUE), .groups = 'drop' ),
by = dplyr::join_by( Month == Month) )
legend_labels <- c(
high_month = "Maximum of the \nhighest temperature",
max_day = "Maximum of Mean \nDaily temperature",
avg_max_day = "Average of \nDaily temperature \nMaximum",
median = "Median of Mean \nDaily temperature",
avg_min_day = "Average of \nDaily temperature \nMinimum",
min_day = "Minimum of Mean \nDaily temperature",
low_month = "Minimum of the \nlowest temperature"
)
legend_colors <- c(high_month = 'red', max_day = 'red', avg_max_day = 'coral', median = 'coral', avg_min_day = 'blue', min_day = 'blueviolet', low_month = 'blueviolet')
legend_shapes <- c(high_month = 24, max_day = 20, avg_max_day = 20, median = 19, avg_min_day = 20, min_day = 20, low_month = 25)
# Automatically defining the scaling function for Two axes of Y - https://finchstudio.io/blog/ggplot-dual-y-axes/
max_first <- max(data$Precipitation, na.rm = TRUE) # Specify max of first y axis
max_second <- max(data$high_month, na.rm = TRUE) # Specify max of second y axis
min_first <- 0 # min(data$Precipitation, na.rm = TRUE) # Specify min of first y axis
min_second <- min(data$low_month, na.rm = TRUE) # Specify min of second y axis
# scale and shift variables calculated based on desired mins and maxes
scale = (max_second - min_second)/(max_first - min_first)
shift = min_first - min_second
data_long <-
data |>
tidyr::pivot_longer( -c(Month, Precipitation), names_to = 'variable', values_to = 'value' ) |>
dplyr::mutate(variable = factor(variable, levels = names(legend_labels)), Precipitation = NULL)
ggplot2::ggplot( data = data_long ) +
ggplot2::geom_col(data = data, aes(x = Month, y = Precipitation, fill = 'Precipitation')) +
ggplot2::geom_text(data = data, aes(label = round(Precipitation, 0), x = Month, y = max(data$Precipitation) * 0.05), size = 3, color = 'cornflowerblue') +
# ggplot2::geom_segment(data = data, aes(x = Month, xend = Month, y = inv_scale_function(low_month, scale, shift), yend = inv_scale_function(high_month, scale, shift)), linewidth = 1, color = 'gold', linetype = 'dashed') +
ggplot2::geom_line( aes(x = Month, y = inv_scale_function(value, scale, shift), group = variable, color = variable, linetype = variable) ) +
ggplot2::geom_point( data = data_long |> dplyr::filter(variable %in% c('high_month', 'median', 'low_month'))
, aes(x = Month, y = inv_scale_function(value, scale, shift),
color = variable, shape = variable) ) +
ggplot2::geom_text(data = data, aes(label = round(median, 1), x = Month, y = inv_scale_function(median, scale, shift)), size = 3, nudge_x = -0.3, nudge_y = 9, color = 'coral') +
ggplot2::scale_fill_manual( values = c(Precipitation = '#a9c4f5'), labels=c(Precipitation = 'Precipitation, mm') ) +
ggplot2::scale_color_manual( values = legend_colors, labels = legend_labels ) +
# ggplot2::scale_fill_manual( values = legend_colors, labels = legend_labels ) +
ggplot2::scale_shape_manual( values = legend_shapes, labels = legend_labels ) +
# ggplot2::scale_linewidth_manual( values = c(high_month = 0.5, max_day = 0.1, avg_max_day = 1, median = 2, avg_min_day = 1, min_day = 0.1, low_month = 0.5), labels = legend_labels ) +
ggplot2::scale_linetype_manual( values = c(high_month = 'blank', max_day = 'dashed', avg_max_day = 'longdash', median = 'solid', avg_min_day = 'longdash', min_day = 'dashed', low_month = 'blank'), labels = legend_labels ) +
ggplot2::scale_y_continuous( name = 'Average Month Precipitation, mm', limits = c(min_first, max_first), breaks = seq(0, 2000, by = ifelse(max_first - min_first > 200, 50, 25)), sec.axis = ggplot2::sec_axis( transform = ~scale_function(., scale, shift), breaks = seq(-40, 40, by = ifelse(max_second - min_second > 30, 5, 2)), name = 'Air Temperature, °C') ) +
ggplot2::labs(title = 'Monthly Air Temperatures and Precipitation') + # , color = 'Color', fill = 'Fill', shape = 'Shape', linetype = 'Line Type') +
ggplot2::theme_minimal() +
# ggplot2::coord_cartesian(ylim = c(15, NA)) +
ggplot2::theme( plot.title = ggplot2::element_text(hjust = 0.5),
legend.position = 'right', legend.text = element_text(size = 7),
legend.title = element_text(size = 8),
axis.title.x = ggplot2::element_blank(),
axis.text.x = ggplot2::element_text(size = 7, vjust = 0.5),
axis.title.y = ggplot2::element_text(size = 9.5, color = 'cornflowerblue'),
axis.text.y = ggplot2::element_text(size = 7, vjust = 0.5, hjust = 1, color = 'cornflowerblue'),
axis.title.y.right = ggplot2::element_text(size = 9.5, color = 'coral'),
axis.text.y.right = ggplot2::element_text(size = 7, vjust = 0.5, hjust = 1, color = 'coral') ) +
ggplot2::guides( fill = ggplot2::guide_legend(title = NULL),
color = ggplot2::guide_legend(title = 'Air Temperature, °C', override.aes = list(shape = legend_shapes)),
shape = 'none',
linetype = ggplot2::guide_legend(title = 'Air Temperature, °C') )
} # The End of function `Union_plot()`
# Пример использования функции
Union_plot(data = meteo_tbl) # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
```
### Column - Temperatures {.tabset width="42%"}
#### Maximum Temperatures
```{r}
#| label: Distribution of Maximum Temperatures by Day
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
#| expandable: false
# Функция создания графика Распределение Переменной по дням Месяцев
MonthDistribution_plot <- function(data, from = min(data$date, na.rm = TRUE), to = max(data$date, na.rm = TRUE),
Col = 'daily_et0_fao_evapotranspiration', Mean_Col = 'daily_temperature_2m_max',
Title = 'Evapotranspiration of a well watered Grass Field & Mean by Months',
Bin_name = 'Evapotranspiration\nBins, mm',
Mean_name = 'Evapotranspiration \nMean, mm',
Bin_breaks = c(0, 0.001, 0.25, 0.5, 1, 2, 5, 10, Inf),
Bin_labels = c("0", "0-0.25", "0.25-0.5", "0.5-1", "1-2", "2-5", "5-10", "more 10")|>
setNames( c("[0,0.001)", "[0.001,0.25)", "[0.25,0.5)", "[0.5,1)", "[1,2)", "[2,5)", "[5,10)", "[10, Inf)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c('azure', "darkgoldenrod1", "darkgoldenrod2", "darkgoldenrod3", "darkgoldenrod" ))(8),
Mean_color = 'darkgoldenrod4', Second_Y_Axes_name = 'mm',
Is_Scaled_Second_Y_Axes = FALSE) {
data <-
data |>
dplyr::filter(date >= from & date <= to)
data0 <- data
data <- if (Col == 'cloud_cover')
# Группы по Ясным, Облачным и Пасмурным дням по дням Месяцев
janitor::tabyl(data0, Month, !!rlang::sym(Col)) else {
# Группы по Градациям Переменной по дням Месяцев
dplyr::mutate(data0, Bin = factor(base::cut(!!rlang::sym(Col), breaks = Bin_breaks, right = FALSE)) ) |>
janitor::tabyl(Month, Bin)
} # The End of if (Col == 'cloud_cover')
data <-
data |>
janitor::adorn_percentages(denominator = 'row') |>
janitor::untabyl() |>
dplyr::left_join(MonthDays_tbl, by = dplyr::join_by(Month == Month)) |>
dplyr::mutate(dplyr::across(dplyr::where(is.numeric), ~ . * Days)) |>
dplyr::select(-Days)
if (Mean_Col == 'daily_temperature_2m_max') y <-
# Среднемесячное число дней ниже нуля
dplyr::mutate(data0, Freezing_Days = dplyr::if_else(!!rlang::sym(Mean_Col) < 0, 1, 0) ) |>
dplyr::group_by(Month) |>
dplyr::summarise(Mean = mean(Freezing_Days, na.rm = TRUE )) |>
dplyr::left_join(MonthDays_tbl, by = dplyr::join_by(Month == Month)) |>
dplyr::mutate(dplyr::across(dplyr::where(is.numeric), ~ . * Days)) |>
dplyr::select(-Days)
# The End of if (Mean_Col == 'daily_temperature_2m_max')
if (Mean_Col == 'daily_temperature_2m_min') y <-
# Среднемесячное число дней выше нуля
dplyr::mutate(data0, Frost_free_Days = dplyr::if_else(!!rlang::sym(Mean_Col) > 0, 1, 0) ) |>
dplyr::group_by(Month) |>
dplyr::summarise(Mean = mean(Frost_free_Days, na.rm = TRUE )) |>
dplyr::left_join(MonthDays_tbl, by = dplyr::join_by(Month == Month)) |>
dplyr::mutate(dplyr::across(dplyr::where(is.numeric), ~ . * Days)) |>
dplyr::select(-Days)
# The End of if (Mean_Col == 'daily_temperature_2m_min')
if (Mean_Col == 'daily_precipitation_sum') y <-
# Среднемесячное количество Дней выпадения атмосферных осадков
dplyr::left_join( x = dplyr::group_by(data0, Month) |> dplyr::count(name = 'All_Days')
, y = dplyr::filter(data0, !!rlang::sym(Mean_Col) > 0) |>
dplyr::group_by(Month) |>
dplyr::count(name = 'Precipitation_Days')
, by = dplyr::join_by(Month == Month) ) |>
dplyr::transmute(Month, Precipitation_Days_Share = Precipitation_Days / All_Days) |>
dplyr::inner_join( MonthDays_tbl, by = dplyr::join_by(Month == Month) )|>
dplyr::transmute(Month, Mean = Precipitation_Days_Share * Days)
# The End of if (Mean_Col == 'daily_precipitation_sum')
if (Mean_Col != 'daily_temperature_2m_max' & Mean_Col != 'daily_temperature_2m_min' & Mean_Col != 'daily_precipitation_sum') y <-
# Среднедневная величина Переменной (Обобщенный Случай)
dplyr::group_by(data0, Month) |>
dplyr::summarise(Mean = mean(!!rlang::sym(Mean_Col), na.rm = TRUE))
# The End of if (Mean_Col != 'daily_temperature_2m_max' & Mean_Col != 'cloud_cover')
data <-
dplyr::inner_join( x = data, y = y, by = dplyr::join_by(Month == Month) )
data_long <-
tidyr::pivot_longer( data,
cols = -c(Month, Mean),
names_to = 'Bin',
values_to = 'value' ) |>
dplyr::mutate( Month = factor(Month, levels = month.abb)
, Mean = if (Mean_Col %in% c('daily_temperature_2m_max', 'daily_temperature_2m_min')) dplyr::if_else(Mean == 0, NA, Mean) else Mean
, Bin = if (Col == 'cloud_cover') factor(Bin, levels = names(data)[c(-1, -ncol(data))]) else {
factor(Bin, levels = rev(names(data)[c(-1, -ncol(data))]),
labels = Bin_labels[ rev(names(data)[c(-1, -ncol(data))]) ]) }
# The End of if (Col == 'cloud_cover')
)
# Automatically defining the scaling function for Two axes of Y - https://finchstudio.io/blog/ggplot-dual-y-axes/
max_first <- ifelse(Col %in% c('daily_relative_humidity_2m_max', 'daily_relative_humidity_2m_min', 'daily_wind_speed_10m_max'), 31, max(data_long$value, na.rm = TRUE)) # Specify max of first y axis
max_second <- max(data$Mean, na.rm = TRUE) # Specify max of second y axis
min_first <- 0 # min(data_long$value, na.rm = TRUE) # Specify min of first y axis
min_second <- ifelse(Col %in% c('daily_relative_humidity_2m_max', 'daily_relative_humidity_2m_min', 'daily_wind_speed_10m_max'), nearest_multiple_of_5_down_function(min(data$Mean, na.rm = TRUE)), 0) # Specify min of second y axis
# scale and shift variables calculated based on desired mins and maxes
scale = (max_second - min_second)/(max_first - min_first)
shift = min_first - min_second
NCol <- ifelse(names(data) |> length() > 10, 2L, 1L) # Кол-во колонок при выводе легенды
if (Col != 'cloud_cover') Bin_colors <- setNames(Bin_colors, Bin_labels)
# Построение сводной столбиковой диаграммы с наложением
p <- ggplot2::ggplot(data_long, aes(x = Month, y = value, fill = Bin)) +
ggplot2::geom_col(color = 'white') +
ggplot2::geom_line(data = dplyr::distinct(data_long, Month, Mean, .keep_all = TRUE), aes(x = Month, y = { if (Is_Scaled_Second_Y_Axes == TRUE) inv_scale_function(Mean, scale, shift) else Mean }, color = 'Mean'), group = 1, linewidth = 0.7) +
ggplot2::geom_text(data = dplyr::distinct(data_long, Month, Mean, .keep_all = TRUE),
aes(label = round(Mean, 1), x = Month, y = { if (Is_Scaled_Second_Y_Axes == TRUE) inv_scale_function(Mean, scale, shift) + 1.5 else Mean + 1.5 }),
size = 3, color = Mean_color) +
ggplot2::scale_fill_manual( values = Bin_colors, labels = Bin_labels, name = Bin_name ) +
ggplot2::scale_color_manual( values = c(Mean = Mean_color), labels = c(Mean = Mean_name) ) +
ggplot2::scale_y_continuous( name = 'Days', minor_breaks = seq(0, 31, by = 1),
sec.axis = ggplot2::sec_axis(transform =
{ if (Is_Scaled_Second_Y_Axes == TRUE) ~scale_function(., scale, shift) else ~ . * 1 },
name = Second_Y_Axes_name,
breaks = { if (Is_Scaled_Second_Y_Axes == TRUE) seq(0, ceiling( max(data$Mean) )
, by = ifelse(Col %in% c('daily_relative_humidity_2m_max', 'daily_relative_humidity_2m_min', 'daily_wind_speed_10m_max'), 5, 0.5) ) else seq(0, 24, by = 2) }) ) +
ggplot2::labs(title = Title) + # , fill = 'Bin', color = 'Mean') +
ggplot2::theme_minimal() +
# ggplot2::coord_cartesian(ylim = c(15, NA)) +
ggplot2::theme( plot.title = ggplot2::element_text(hjust = 0.5),
legend.position = 'right', legend.text = element_text(size = 7),
legend.title = element_text(size = 8),
axis.title.x = ggplot2::element_blank(),
axis.text.x = ggplot2::element_text(size = 7, vjust = 0.5),
axis.title.y = ggplot2::element_text(size = 9.5, color = 'black'),
axis.text.y = ggplot2::element_text(size = 7, vjust = 0.5, hjust = 1, color = 'black'),
axis.title.y.right = ggplot2::element_text(size = 9.5, color = Mean_color),
axis.text.y.right = ggplot2::element_text(size = 7, vjust = 0.5, hjust=1, color = Mean_color)
) +
ggplot2::guides( color = ggplot2::guide_legend(title = NULL, order = 1),
fill = ggplot2::guide_legend(ncol = NCol) )
return(p)
} # The End of function `MonthDistribution_plot()`
# Диаграмма Распределения Максимальных температур по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_temperature_2m_max', Mean_Col = 'daily_temperature_2m_max',
Title = 'Maximum Temperatures & Freezing Days by Months',
Bin_name = 'Temperature Bins, °C',
Mean_name = 'Freezing \nDays',
Bin_breaks = c(-Inf, -70, -50, seq(-32, 40, by = 4), 46, Inf),
Bin_labels = c("less -70", "-70/-50", "-50/-32", "-32/-28", "-28/-24", "-24/-20", "-20/-16", "-16/-12", "-12/-8", "-8/-4", "-4/0", "0/4", "4/8", "8/12", "12/16", "16/20", "20/24", "24/28", "28/32", "32/36", "36/40", "40/46", "more 46") |>
setNames( c("[-Inf,-70)", "[-70,-50)", "[-50,-32)", "[-32,-28)", "[-28,-24)", "[-24,-20)", "[-20,-16)", "[-16,-12)", "[-12,-8)", "[-8,-4)", "[-4,0)", "[0,4)", "[4,8)", "[8,12)", "[12,16)", "[16,20)", "[20,24)", "[24,28)", "[28,32)", "[32,36)", "[36,40)", "[40,46)", "[46, Inf)") ),
Bin_colors = c("#9400D3", "#6400B8", "#35009D", "#050083", "#13248E", "#294D9F", "#4077AF", "#3594BA", "#1EABC2", "#08C3CA", "#00F7F7", "#00FF84", "#00FF33", "#1EFA00", "#70ED00", "#C1E000", "#FFCF06", "#FFB31F", "#FF9739", "#FA7A50", "#D55450", "#B02F50", "#8B0A50"),
Mean_color = 'steelblue4', Second_Y_Axes_name = 'Days')
```
#### Minimum Temperatures
```{r}
#| label: Distribution of Minimum Temperatures by Day
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
#| expandable: false
# Диаграмма Распределения Минимальных температур по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_temperature_2m_min', Mean_Col = 'daily_temperature_2m_min',
Title = 'Minimum Temperatures & Frost-free Days by Months',
Bin_name = 'Temperature Bins, °C',
Mean_name = 'Frost-free \nDays',
Bin_breaks = c(-Inf, -70, -50, seq(-32, 40, by = 4), 46, Inf),
Bin_labels = c("less -70", "-70/-50", "-50/-32", "-32/-28", "-28/-24", "-24/-20", "-20/-16", "-16/-12", "-12/-8", "-8/-4", "-4/0", "0/4", "4/8", "8/12", "12/16", "16/20", "20/24", "24/28", "28/32", "32/36", "36/40", "40/46", "more 46") |>
setNames( c("[-Inf,-70)", "[-70,-50)", "[-50,-32)", "[-32,-28)", "[-28,-24)", "[-24,-20)", "[-20,-16)", "[-16,-12)", "[-12,-8)", "[-8,-4)", "[-4,0)", "[0,4)", "[4,8)", "[8,12)", "[12,16)", "[16,20)", "[20,24)", "[24,28)", "[28,32)", "[32,36)", "[36,40)", "[40,46)", "[46, Inf)") ),
Bin_colors = c("#9400D3", "#6400B8", "#35009D", "#050083", "#13248E", "#294D9F", "#4077AF", "#3594BA", "#1EABC2", "#08C3CA", "#00F7F7", "#00FF84", "#00FF33", "#1EFA00", "#70ED00", "#C1E000", "#FFCF06", "#FFB31F", "#FF9739", "#FA7A50", "#D55450", "#B02F50", "#8B0A50"),
Mean_color = 'darkorange3', Second_Y_Axes_name = 'Days')
```
# Precipitation & Relative Humidity
## Row - Charts {height="100%"}
### Column - Precipitation {width="50%"}
```{r}
#| label: Cloudy, Sunny and Precipitation Days Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Диаграмма Распределения когда было Облачно, Солнечно и Дням осадков
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'cloud_cover', Mean_Col = 'daily_precipitation_sum',
Title = 'Cloudiness & Precipitation Days by Months',
Bin_name = 'Cloudiness by \nMonths, Days',
Mean_name = 'Precipitation \nDays',
Bin_breaks = NULL,
Bin_labels = c(Sunny = 'Sunny', `Partly Cloudy` = 'Partly Cloudy', Overcast = 'Overcast'),
Bin_colors = c(Sunny = 'yellow', `Partly Cloudy` = '#D8D594', Overcast = 'lightskyblue4'),
Mean_color = 'cornflowerblue', Second_Y_Axes_name = 'Days')
```
```{r}
#| label: Distribution of Precipitation Amount by Day Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Диаграмма Распределения Количества Осадков по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_precipitation_sum', Mean_Col = 'daily_precipitation_hours',
Title = 'Daily Precipitation Amount & Precipitation Hours by Months',
Bin_name = 'Daily Precipitation \nBins, mm',
Mean_name = 'Daily Precipitation, \nHours',
Bin_breaks = c(-Inf, 0.1, 2, 5, 10, 20, 50, 100, Inf),
Bin_labels = c("Dry Days", "0-2", "2-5", "5-10", "10-20", "20-50", "50-100", "more 100") |>
setNames( c("[-Inf,0.1)", "[0.1,2)", "[2,5)", "[5,10)", "[10,20)", "[20,50)", "[50,100)", "[100, Inf)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c("#E4E075", "cadetblue1", "cornflowerblue", "blue" ))(12)[-c(2:5)],
Mean_color = 'blue', Second_Y_Axes_name = 'Hours')
```
### Column - Relative Humidity {width="50%"}
```{r}
#| label: Distribution of Maximum Relative Humidity by Day Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Диаграмма Распределения Максимальной Относительной Влажности по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_relative_humidity_2m_max', Mean_Col = 'daily_relative_humidity_2m_max',
Title = 'Maximum Relative Humidity Days by Months',
Bin_name = 'Maximum Relative \nHumidity Bins, %',
Mean_name = 'Average Maximum \nRelative Humidity, %',
Bin_breaks = c(0, seq(10, 105, by = 5)),
Bin_labels = c("less 10", "10-15", "15-20", "20-25", "25-30", "30-35", "35-40", "40-45", "45-50", "50-55", "55-60", "60-65", "65-70", "70-75", "75-80", "80-85", "85-90", "90-95", "95-99", "100") |>
setNames( c("[0,10)", "[10,15)", "[15,20)", "[20,25)", "[25,30)", "[30,35)", "[35,40)", "[40,45)", "[45,50)", "[50,55)", "[55,60)", "[60,65)", "[65,70)", "[70,75)", "[75,80)", "[80,85)", "[85,90)", "[90,95)", "[95,100)", "[100,105)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c("#ecf0fc", "#d9e1f9", "#c6d2f6", "#b3c3f3", "#a0b4f0", "#8da5ed", "#7a96ea", "#6687e7"))(20),
Mean_color = 'darkblue', Second_Y_Axes_name = 'Relative Humidity, %',
Is_Scaled_Second_Y_Axes = TRUE)
```
```{r}
#| label: Distribution of Minimum Relative Humidity by Day Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Диаграмма Распределения Минимальной Относительной Влажности по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_relative_humidity_2m_min', Mean_Col = 'daily_relative_humidity_2m_min',
Title = 'Minimum Relative Humidity Days by Months',
Bin_name = 'Minimum Relative \nHumidity Bins, %',
Mean_name = 'Average Minimum \nRelative Humidity, %',
Bin_breaks = c(0, seq(10, 105, by = 5)),
Bin_labels = c("less 10", "10-15", "15-20", "20-25", "25-30", "30-35", "35-40", "40-45", "45-50", "50-55", "55-60", "60-65", "65-70", "70-75", "75-80", "80-85", "85-90", "90-95", "95-99", "100") |>
setNames( c("[0,10)", "[10,15)", "[15,20)", "[20,25)", "[25,30)", "[30,35)", "[35,40)", "[40,45)", "[45,50)", "[50,55)", "[55,60)", "[60,65)", "[65,70)", "[70,75)", "[75,80)", "[80,85)", "[85,90)", "[90,95)", "[95,100)", "[100,105)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c("#ecf0fc", "#d9e1f9", "#c6d2f6", "#b3c3f3", "#a0b4f0", "#8da5ed", "#7a96ea", "#6687e7"))(20),
Mean_color = 'darkblue', Second_Y_Axes_name = 'Relative Humidity, %',
Is_Scaled_Second_Y_Axes = TRUE)
```
# Radiation & Winds
## Row - Charts {height="100%"}
### Column - Radiation {width="50%"}
```{r}
#| label: Distribution of Shortwave Radiation by Day Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Диаграмма Распределения Коротковолновой Солнечной Радиации по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_shortwave_radiation_sum', Mean_Col = 'daily_shortwave_radiation_sum',
Title = 'Shortwave Radiation Amount & Mean by Months',
Bin_name = 'Shortwave \nRadiation\nBins, W/m²',
Mean_name = 'Shortwave \nRadiation\nMean, W/m²',
Bin_breaks = c(-Inf, 1, 2, 5, 10, 15, 20, 25, Inf),
Bin_labels = c("0-1", "1-2", "2-5", "5-10", "10-15", "15-20", "20-25", "more 25") |>
setNames( c("[-Inf,1)", "[1,2)", "[2,5)", "[5,10)", "[10,15)", "[15,20)", "[20,25)", "[25, Inf)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c('#fff1e1', "bisque", "#ff9d57", "chocolate1", "chocolate3" ))(8),
Mean_color = 'brown', Second_Y_Axes_name = 'W/m²')
```
```{r}
#| label: Distribution of Evapotranspiration by Day Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Функция создания графика Распределение эталонного испарения хорошо орошаемого травяного поля по ФАО по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_et0_fao_evapotranspiration', Mean_Col = 'daily_et0_fao_evapotranspiration',
Title = 'Evapotranspiration of a well watered Grass Field & Mean by Months',
Bin_name = 'Evapotrans-\npiration\nBins, mm',
Mean_name = 'Evapotranspiration \nMean, mm',
Bin_breaks = c(0, 0.001, 0.25, 0.5, 1, 2, 5, 10, Inf),
Bin_labels = c("0", "0-0.25", "0.25-0.5", "0.5-1", "1-2", "2-5", "5-10", "more 10")|>
setNames( c("[0,0.001)", "[0.001,0.25)", "[0.25,0.5)", "[0.5,1)", "[1,2)", "[2,5)", "[5,10)", "[10,Inf)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c('azure', '#eeffff', '#d5ffff', '#9EEFE7', '#8BECE2', "turquoise1"))(8),
Mean_color = 'darkgoldenrod4', Second_Y_Axes_name = 'mm',
Is_Scaled_Second_Y_Axes = TRUE)
```
### Column - Winds {width="50%"}
```{r}
#| label: Distribution of Speed Winds by Day Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Диаграмма Распределения Скорости ветра на уровни 10 м по дням Месяцев
MonthDistribution_plot(data = meteo_tbl, # , from = as.Date(params$Start_Date), to = as.Date(params$Finish_Date)
Col = 'daily_wind_speed_10m_max', Mean_Col = 'daily_wind_speed_10m_max',
Title = 'Maximum Wind Speed 10 Meters Days by Months',
Bin_name = 'Maximum Wind \nSpeed Bins, km/h',
Mean_name = 'Average Maximum \nWind Speed, km/h',
Bin_breaks = seq(0, 105, by = 5),
Bin_labels = c("0-5", "5-10", "10-15", "15-20", "20-25", "25-30", "30-35", "35-40", "40-45", "45-50", "50-55", "55-60", "60-65", "65-70", "70-75", "75-80", "80-85-", "85-90", "90-95", "95-100", "100-105") |>
setNames( c("[0,5)", "[5,10)", "[10,15)", "[15,20)", "[20,25)", "[25,30)", "[30,35)", "[35,40)", "[40,45)", "[45,50)", "[50,55)", "[55,60)", "[60,65)", "[65,70)", "[70,75)", "[75,80)", "[80,85)", "[85,90)", "[90,95)", "[95,100)", "[100-105)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c('chartreuse4', 'chartreuse3', 'chartreuse2', "chartreuse1", 'yellow', 'darkorange'))(21),
Mean_color = 'darkolivegreen', Second_Y_Axes_name = 'Maximum Wind Speed, km/h',
Is_Scaled_Second_Y_Axes = TRUE)
```
```{r}
#| label: Distribution of Wind Speed Rose by Day Chart
#| fig-asp: !expr "ifelse(interactive() == TRUE, 1, 0.4)"
# Диаграмма Распределения Скорости ветра на уровни 10 м по сторонам света
Wind_Speed_Rose_plot <- function(data, from = min(data$date, na.rm = TRUE), to = max(data$date, na.rm = TRUE),
Col = 'daily_wind_direction_10m_dominant', Mean_Col = 'daily_wind_speed_10m_max',
Title = 'Wind Speed Rose',
Bin_name = 'Maximum Wind Speed Bins, km/h',
Bin_breaks = seq(0, 105, by = 5),
Bin_labels = c("0-5", "5-10", "10-15", "15-20", "20-25", "25-30", "30-35", "35-40", "40-45", "45-50", "50-55", "55-60", "60-65", "65-70", "70-75", "75-80", "80-85-", "85-90", "90-95", "95-100", "100-105") |>
setNames( c("[0,5)", "[5,10)", "[10,15)", "[15,20)", "[20,25)", "[25,30)", "[30,35)", "[35,40)", "[40,45)", "[45,50)", "[50,55)", "[55,60)", "[60,65)", "[65,70)", "[70,75)", "[75,80)", "[80,85)", "[85,90)", "[90,95)", "[95,100)", "[100-105)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c("darkorange", "yellow", "chartreuse1", "chartreuse2", "chartreuse3", "chartreuse4"))(21)) {
Directions <- c('NNE', 'NE', 'ENE', 'E', 'ESE', 'SE', 'SSE', 'S', 'SSW', 'SW', 'WSW', 'W', 'WNW', 'NW', 'NNW', 'N')
data <-
data |>
dplyr::filter(date >= from & date <= to) |>
# Группы по Градациям Переменной по дням Месяцев
dplyr::mutate( Bin = factor(base::cut(!!rlang::sym(Mean_Col), breaks = Bin_breaks, right = FALSE))
, Direction = factor( forcats::fct_collapse( cut(!!rlang::sym(Col), breaks = seq(-11.25, 360 + 11.25, by = 22.5), right = FALSE), N = c('[-11.2,11.2)', '[349,371)')), labels = Directions ) ) |>
janitor::tabyl(Direction, Bin)
data_long <-
tidyr::pivot_longer( data,
cols = -c(Direction),
names_to = 'Bin',
values_to = 'value' ) |>
dplyr::mutate( Direction = factor(Direction, levels = Directions)
, Bin = factor(Bin, levels = rev(names(data)[-1]),
labels = rev(Bin_labels[ names(data)[-1] ]) ) )
NCol <- ifelse(names(data) |> length() > 10, 2L, 1L) # Кол-во колонок при выводе легенды
# Построение сводной столбиковой диаграммы с наложением
ggplot2::ggplot(data_long, aes(x = Direction, y = value, fill = Bin)) +
ggplot2::geom_col(color = 'white') +
ggplot2::scale_fill_manual( values = setNames(Bin_colors, rev(Bin_labels)), name = Bin_name ) +
ggplot2::scale_y_continuous( labels = NULL ) +
ggplot2::labs(title = Title, y = '') + # , fill = 'Cloudiness', color = 'Precipitation Days') +
ggplot2::theme_minimal() +
# ggplot2::coord_cartesian(ylim = c(15, NA)) +
ggplot2::coord_polar(theta = 'x', start = 11.25 * (pi / 180)) +
ggplot2::theme( plot.title = ggplot2::element_text(hjust = 0.5),
legend.position = 'right', legend.text = element_text(size = 7),
legend.title = element_text(size = 8),
axis.title.x = ggplot2::element_blank(),
axis.text.x = ggplot2::element_text(size = 7, vjust = 0.5)
) +
ggplot2::guides( fill = ggplot2::guide_legend(ncol = NCol) )
} # The End of function `Maximum_Relative_Humidity_plot()`
# Пример использования функции
Wind_Speed_Rose_plot(data = meteo_tbl, # from = min(data$date, na.rm = TRUE), to = max(data$date, na.rm = TRUE),
Col = 'daily_wind_direction_10m_dominant', Mean_Col = 'daily_wind_speed_10m_max',
Title = 'Wind Speed Rose',
Bin_name = 'Maximum Wind Speed Bins, km/h',
Bin_breaks = seq(0, 105, by = 5),
Bin_labels = c("0-5", "5-10", "10-15", "15-20", "20-25", "25-30", "30-35", "35-40", "40-45", "45-50", "50-55", "55-60", "60-65", "65-70", "70-75", "75-80", "80-85-", "85-90", "90-95", "95-100", "100-105") |>
setNames( c("[0,5)", "[5,10)", "[10,15)", "[15,20)", "[20,25)", "[25,30)", "[30,35)", "[35,40)", "[40,45)", "[45,50)", "[50,55)", "[55,60)", "[60,65)", "[65,70)", "[70,75)", "[75,80)", "[80,85)", "[85,90)", "[90,95)", "[95,100)", "[100-105)") ),
Bin_colors = grDevices::colorRampPalette(c("darkorange", "yellow", "chartreuse1", "chartreuse2", "chartreuse3", "chartreuse4"))(21))
```
# Data & Map {orientation="columns" scrolling="true"}
::: {.card title="Let's look at the tabular data" width="70%"}
Now let's take a closer look at the details of the data set.:
```{r}
#| label: Interaction Table
meteo_tbl |>
dplyr::select(-Weather, -Conditions) |>
DT::datatable(options = list(dom = 'ftip', paging = TRUE) ) # buttons = c('copy', 'csv', 'excel'), scrollX = TRUE, fixedColumns = list(leftColumns = 2, rightColumns = 1),
```
:::
:::: {.card title="Let's consider the location of a geographic object" width="30%"}
`{r} Subtitle` fits here:
```{r}
#| label: Interaction Map
leaflet::leaflet() |>
# leaflet::addTiles(group = "OSM (default)") |>
# leaflet::addProviderTiles(providers$CartoDB.Positron, group = "Positron (minimal)") |>
leaflet::addProviderTiles(providers$Esri.WorldImagery, group = "World Imagery (satellite)") |>
# leaflet::addProviderTiles(providers$Stadia.StamenTerrain, group = "World Terrain (color)") |>
leaflet::addMarkers(lng = params$loc_coordinats['longitude'], lat = params$loc_coordinats['latitude'],
popup = paste0(params$loc_name, ' (', params$loc_code, ')' )) |>
leaflet::setView(lng = as.double(params$loc_coordinats['longitude']),
lat = as.double(params$loc_coordinats['latitude']), zoom = 7)
# leaflet::leaflet() |>
# leaflet::addTiles() |>
# leaflet::addProviderTiles(providers$Stamen.Terrain) |>
# leaflet::addMarkers(lng = params$loc_coordinats['longitude'], lat = params$loc_coordinats['latitude'],
# popup = paste0(params$loc_name, ' (', params$loc_code, ')' )) |>
# leaflet::fitBounds(lng1 = params$loc_coordinats['longitude'] - 0.2, lat1 = params$loc_coordinats['latitude'] - 0.2,
# lng2 = params$loc_coordinats['longitude'] + 0.2, lat2 = params$loc_coordinats['latitude'] + 0.2)
```
::: {.callout-caution collapse="true"}
```{r}
#| label: The End of Session
#| title: 'What packages were used?'
#| comment: ''
# The End of Session
devtools::session_info()
Sys.time()
```
:::